O Instituto de Matemática mantém seis cursos de pós-graduação stricto sensu e um curso de pós-graduação lato sensu.
Stricto Sensu
Programa de Matemática,
transferido para o IM em 1971, com origem no mestrado do Programa de Engenharia Matemática da COPPE.
Foi credenciado pelo Conselho Federal de Educação em 1976.
Programa de Matemática Aplicada, aprovado pelo Conselho de Ensino para Graduados e
Pesquisa da UFRJ em 1995 e recomendado pelo GTC/CAPES em 1996.
Programa de História das Ciências e das Técnicas e Epistemologia
aprovado pela Capes em outubro de 2005, é um programa inter-institucional com a participação do
Instituto de Química e da COPPE, como principais fomentadores e o
Instituto de Física e Ciências Sociais, como colaboradores.
Lato Sensu
Especialização para Professores de Matemática, implantado em 1992,
nascido do trabalho com formação continuada de professores de 1º. e 2º.
graus de Matemática de equipe do Projeto Fundão, setor Matemática.